Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms