Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBL1P28749 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBL1P28749 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBL1P28749 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBL1P28749 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBL1P28749 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBL1P28749 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBL1P28749 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBL1P28749 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBL1P28749 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RBL1P28749 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBL1P28749 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBL1P28749 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RBL1P28749 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBL1P28749 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBL1P28749 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBL1P28749 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBL1P28749 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBL1P28749 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBL1P28749 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBL1P28749 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBL1P28749 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBL1P28749 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBL1P28749 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBL1P28749 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBL1P28749 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBL1P28749 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBL1P28749 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBL1P28749 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBL1P28749 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBL1P28749 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBL1P28749 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBL1P28749 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBL1P28749 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBL1P28749 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBL1P28749 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBL1P28749 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBL1P28749 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms