Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms