Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms