Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms