Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCP1P17987 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCP1P17987 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCP1P17987 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCP1P17987 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCP1P17987 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCP1P17987 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCP1P17987 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCP1P17987 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCP1P17987 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCP1P17987 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCP1P17987 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCP1P17987 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCP1P17987 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCP1P17987 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCP1P17987 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TCP1P17987 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCP1P17987 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCP1P17987 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCP1P17987 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCP1P17987 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TCP1P17987 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCP1P17987 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TCP1P17987 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCP1P17987 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCP1P17987 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCP1P17987 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCP1P17987 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCP1P17987 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCP1P17987 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCP1P17987 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCP1P17987 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCP1P17987 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCP1P17987 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms