Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms