Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA2P17301 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms