Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms