Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGBP11216 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 AP001830.1-201ENST00000528717 692 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGBP11216 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 HIST2H4B-201ENST00000579512 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PYGBP11216 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms