Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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