Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms