Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA4P06727 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA4P06727 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA4P06727 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA4P06727 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA4P06727 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA4P06727 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOA4P06727 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOA4P06727 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOA4P06727 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA4P06727 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA4P06727 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms