Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms