Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms