Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIC3O60481 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms