Protein–RNA interactions for Protein: O43323

DHH, Desert hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHHO43323 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DHHO43323 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DHHO43323 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DHHO43323 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DHHO43323 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DHHO43323 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DHHO43323 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DHHO43323 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DHHO43323 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DHHO43323 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DHHO43323 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DHHO43323 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DHHO43323 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DHHO43323 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DHHO43323 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DHHO43323 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DHHO43323 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DHHO43323 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DHHO43323 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DHHO43323 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DHHO43323 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DHHO43323 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms