Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms