Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP290O15078 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP290O15078 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP290O15078 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP290O15078 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP290O15078 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP290O15078 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP290O15078 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP290O15078 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP290O15078 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP290O15078 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP290O15078 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP290O15078 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP290O15078 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP290O15078 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP290O15078 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms