Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
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