Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms