Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCER2I3L3R5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms