Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms