Protein–RNA interactions for Protein: A8MV72

Putative UPF0607 protein ENSP00000382826, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MV72 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A8MV72 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A8MV72 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A8MV72 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A8MV72 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A8MV72 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A8MV72 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A8MV72 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A8MV72 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A8MV72 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A8MV72 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A8MV72 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A8MV72 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A8MV72 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A8MV72 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A8MV72 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A8MV72 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A8MV72 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A8MV72 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A8MV72 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms