Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KNSTRNQ9Y448 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms