Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT52Q9Y366 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms