Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP3Q9Y2W1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms