Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPS28Q9Y2Q9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms