Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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UBQLN2Q9UHD9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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UBQLN2Q9UHD9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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UBQLN2Q9UHD9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN2Q9UHD9 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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