Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms