Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms