Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLKQ9UBT6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms