Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms