Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms