Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms