Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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