Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms