Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED17Q9NVC6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms