Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6BQ9NRW1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms