Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PARD6AQ9NPB6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms