Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NRDE2Q9H7Z3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms