Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
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FOXQ1Q9C009 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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FOXQ1Q9C009 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
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FOXQ1Q9C009 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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FOXQ1Q9C009 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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FOXQ1Q9C009 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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