Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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KRTAP1-5Q9BYS1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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KRTAP1-5Q9BYS1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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KRTAP1-5Q9BYS1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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KRTAP1-5Q9BYS1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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KRTAP1-5Q9BYS1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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KRTAP1-5Q9BYS1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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KRTAP1-5Q9BYS1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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