Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NIFKQ9BYG3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms