Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms