Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms