Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms