Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms