Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BPIFA3Q9BQP9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms