Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CICQ96RK0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CICQ96RK0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CICQ96RK0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CICQ96RK0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CICQ96RK0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CICQ96RK0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CICQ96RK0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CICQ96RK0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CICQ96RK0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CICQ96RK0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CICQ96RK0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CICQ96RK0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CICQ96RK0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
CICQ96RK0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
CICQ96RK0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
CICQ96RK0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CICQ96RK0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CICQ96RK0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CICQ96RK0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CICQ96RK0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CICQ96RK0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CICQ96RK0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CICQ96RK0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CICQ96RK0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CICQ96RK0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CICQ96RK0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CICQ96RK0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms